Τα πακέτα λογισμικού είναι διαθέσιμα για λειτουργικά συστήματα: Linux, Windows και  MacOS.

Για τα προϊόντα παρέχεται από το Υπολογιστικό Κέντρο (Υ/Κ) τεχνική υποστήριξη τηλεφωνικά  ή μέσω e-mail.

Για πακέτα λογισμικού γενικού ενδιαφέροντος που δεν διατίθενται, το Υ/Κ προβαίνει σε προμήθεια είτε μεμονωμένων είτε πολλαπλών (multilicense) αδειών χρήσης.

Ειδικότερα στο Υ/Κ υπάρχουν εγκατεστημένα ή διανέμονται για τοπική εγκατάσταση:

• Λογισμικά Ανοιχτού Κώδικα : , Gnu C/C++, HP Fortran 90/77, Linux Intel Fortran, Pgplot
• Επιστημονικά πακέτα:  MATLAB,  Gaussian, Οrca, ArcGIS, Gromacs, MolPro
• Στατιστικά πακέτα : SPSS, AMOS, SAS, Primer-E/Permanova+

Υπάρχουν οδηγίες εγκατάστασης για τα πακέτα λογισμικού που διανέμει ελεύθερα το Υ/Κ.